Selon l'Agence de presse polonaise, le Dr Łukasz Rąbalski de l'Université de Gdańsk a été le premier en Pologne à obtenir la séquence génétique complète du coronavirus SRAS-CoV-2, isolé directement à partir d'un patient polonais, et l'a publiée dans la base de données mondiale GISAID.
Le Dr Łukasz Rąbalski est professeur adjoint au Département des vaccins recombinants de la Faculté interuniversitaire de biotechnologie de l'Université de Gdańsk et de l'Université de médecine de Gdańsk.
Le matériel génétique a été isolé dans le laboratoire de biologie moléculaire et de diagnostic de la société à responsabilité limitée, situé au 7e hôpital naval de Gdańsk. C'est un laboratoire qui a été créé grâce au transfert d'équipements spécialisés par l'Université de Gdańsk.
La porte-parole de la presse de l'Université de Gdańsk, Beata Czechowska-Derkacz, a fait part du succès du scientifique. Comme nous le lisons dans les communications de l'agence de presse polonaise:
"Les données obtenues permettront aux scientifiques du monde entier de prendre en compte la Pologne dans leurs recherches liées à l'épidémiologie de la maladie COVID-19. C'est une contribution importante à la compréhension de l'évolution moléculaire du virus et peut contribuer à la sélection d'un vaccin et de médicaments à l'avenir. Jusqu'à présent, le GISAID en la plus grande base de données, où des scientifiques du monde entier ont déjà placé plus de 5000 séquences, il n'y avait pas un seul isolat polonais directement du patient »- a souligné la porte-parole de l'Université de Gdańsk.
La séquence génétique contient de nombreuses informations importantes, telles que la manière dont un virus «trompe» le corps humain, affaiblissant son immunité.
"En isolant une telle séquence, c'est-à-dire en décodant le virus, il est possible de mieux comprendre les propriétés du virus, y compris son origine, à la fois dans le contexte évolutif et géographique" - a expliqué Beata Czechowska-Derkacz.
Lors du décodage du virus d'un patient polonais en Poméranie, la dernière génération de séquenceurs Oxford Nanopore Technologies a été utilisée, ce qui signifie qu'aucune procédure supplémentaire ne peut introduire des distorsions. Des protocoles de bioinformatique précédemment développés par des scientifiques de ARTIC pour collecter des données génétiques pendant l'épidémie d'Ebola en Afrique ont également été utilisés.
«Le matériel génétique doit répondre à de nombreuses normes qualitatives et quantitatives afin de pouvoir le décoder. Dans le cas des virus dont le matériel génétique est de l'ARN simple brin, des méthodes qui multiplient la quantité de matériel génétique sont utilisées.
Normalement, jusqu'à présent, cela se faisait en répliquant des particules virales en laboratoire. Actuellement, grâce aux réalisations dans le domaine de la biologie moléculaire, un chemin plus court peut être utilisé sans avoir besoin de cultiver le virus »- a expliqué le Dr Rąbalski, cité dans le communiqué de presse.
Le séquençage ultérieur des virus de patients polonais isolés également au laboratoire d'hématologie du centre clinique universitaire de Gdańsk est actuellement en cours, et d'autres séquences devraient être envoyées dans les prochains jours.
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