Culture (test microbiologique) - qu'est-ce que c'est? Indications pour la culture

La culture est un test microbiologique visant à détecter et identifier les micro-organismes dans le sang, l'urine, les selles ou tout autre matériel biologique. L'inoculation est un processus en plusieurs étapes et n'est effectuée que dans des cas justifiés. Vérifiez quelles sont les indications de la culture et en quoi consiste le test.

La culture est un test microbiologique effectué pour détecter et identifier les agents pathogènes dans des échantillons de matériel biologique.

En raison du type d'agents pathogènes testés, on distingue la culture bactériologique (test bactériologique) et la culture mycologique (test mycologique).

En raison du type de matériel biologique, il existe des cultures de sang, d'urine, de matières fécales, de sperme, d'expectorations ou de pertes vaginales. Le matériel biologique peut également être du liquide céphalo-rachidien, des prélèvements de la gorge, de l'oreille, du nez, de la muqueuse buccale et même des sacs conjonctivaux des yeux, des pustules et autres lésions cutanées, ainsi que des plaies, des fistules ou des abcès, etc.

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Culture - indications pour l'étude

La culture est réalisée lorsqu'une infection est suspectée, c'est-à-dire lorsque le patient développe des symptômes. Par exemple, l'indication de la culture d'urine sera les symptômes d'une infection des voies urinaires comme une lombalgie ou des mictions fréquentes et douloureuses. En revanche, une infection de la circulation sanguine peut être suspectée en présence de fièvre et de frissons, d'une respiration et d'un rythme cardiaque rapides, d'une baisse de la pression artérielle, d'une altération de la conscience ou d'oligurie. En revanche, la culture des selles est réalisée sur un patient qui a la diarrhée, des crampes abdominales et / ou du sang ou du mucus dans les selles.

La culture de l'urine et des pertes vaginales doit être effectuée chez la femme enceinte - même en l'absence de symptômes d'infection - pour exclure la présence de micro-organismes pouvant constituer une menace pour le bébé.

Culture - collecte de matériel biologique

Premièrement, un échantillon de matériel biologique doit être correctement collecté. Dans le cas de l'hémoculture, au moins deux échantillons de sang doivent être prélevés dans deux veines différentes, dans deux tubes contenant deux types de milieu de culture (permettant la détection des bactéries aérobies et anaérobies). À son tour, le matériel biologique du vagin est collecté avec un écouvillon spécial - un écouvillon est prélevé dans le vestibule vaginal et l'autre dans la zone de l'anus. Ensuite, les écouvillons sont également placés sur un substrat spécial (appelé substrat de transport). D'autre part, la culture d'urine est effectuée sur le premier échantillon, l'urine après la nuit (alors le nombre de bactéries est le plus élevé), qui est collecté dans un récipient stérile à l'aide du soi-disant courant moyen.

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Avant d'effectuer la culture, informez votre médecin de tous les médicaments que vous prenez (en particulier les antibiotiques et les médicaments qui affectent la coagulation sanguine), les conditions médicales et les éventuels porteurs d'agents pathogènes à diffusion hématogène (p. Ex. VHB, VHC, VIH).

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Culture - quel est le test?

ÉTAPE 1 - SEMIS

La première étape consiste à ensemencer le matériel biologique, c'est-à-dire à appliquer un échantillon du matériel au soi-disant milieu de culture (microbiologique). C'est un mélange de nutriments soigneusement sélectionnés qui permettent la croissance et la multiplication des micro-organismes. Les milieux de croissance enrichis en sang sont les plus couramment utilisés car ils fournissent des conditions optimales pour la croissance de la plupart des espèces de pathogènes.

L'inoculation peut être réalisée de plusieurs manières: sur un milieu liquide, sur une gélose inclinée, mais le plus souvent elle est réalisée sur des boîtes de Pétri (c'est un récipient de laboratoire, un support cylindrique à fond large et plat), c'est-à-dire qu'un peu du matériel testé est étalé en zigzag ou radialement sur toute la surface substrats, ou ils sont divisés en secteurs et le matériau y est distribué.

Habituellement, l'inoculation est effectuée sous une cellule laminaire qui permet une condition stérile. La chambre empêche les bactéries ou les spores fongiques, qui flottent constamment dans l'air à l'extérieur de la chambre, de pénétrer dans la chambre.

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C'est le cas, par exemple, dans le cas de la culture d'urine. Dans le cas de l'hémoculture, cette étape est omise car le milieu est placé dans des bouteilles stériles ou des tubes à essai dans lesquels le sang est directement aspiré. Il en va de même pour les écouvillons, qui sont placés sur un support spécial immédiatement après le prélèvement et immédiatement destinés à la reproduction.

ÉTAPE 2 - ÉLEVAGE

Une fois l'échantillon appliqué sur le substrat, il est placé dans un incubateur, où la température correspond à celle du corps humain. Ce sont les conditions qui conduisent à la multiplication des micro-organismes. La stimulation de la croissance des micro-organismes souhaités peut également être obtenue en sélectionnant le pH et l'oxygénation appropriés. La culture d'agents pathogènes dure de 24 à 48 heures (certaines espèces de bactéries) à même plusieurs dizaines de jours (certains champignons).

ÉTAPE 3 - ISOLATION

Le but de cette étape est d'isoler une espèce spécifique d'agent pathogène. Dans le cas de l'isolement de micro-organismes, une suspension bactérienne d'une densité spécifique est préparée, qui sera utilisée pour identifier et déterminer la sensibilité médicamenteuse de la souche.

ÉTAPE 4 - IDENTIFICATION

Actuellement, des tests biochimiques, manuels ou automatiques sont utilisés pour identifier les micro-organismes. Le test API est un exemple de test biochimique. Il consiste à introduire la suspension bactérienne dans chacun des microtubes inclus dans l'ensemble. La prochaine étape est la culture de micro-organismes à la bonne température. Les réactions biochimiques qui se produisent pendant cette période entraîneront des changements de couleur, soit spontanément, soit après l'ajout du réactif indicateur. Un livre de codes ou un programme informatique spécial est utilisé pour la lecture.

Le diagnostic microbiologique est complété par une préparation microscopique qui permet l'observation des cellules pathogènes après leur coloration préalable.

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ÉTAPE 5 - ANTIBIOGRAMME

Une fois l'inoculation terminée, un antibiogramme est effectué pour évaluer la sensibilité de l'agent pathogène au médicament. Le microbiologiste place des disques avec des antibiotiques de concentrations spécifiques sur un milieu approprié avec la suspension bactérienne appliquée (ce que l'on appelle l'antibiogramme). Les lectures d'antibiotiques sont effectuées en mesurant la taille des zones d'inhibition autour des disques antibiotiques.

Sur la base des résultats de l'examen microbiologique et de l'antibiogramme, le médecin décide du traitement approprié.